Χωριά

Η κωμόπολη Βουρλιώτες βρίσκεται δυτικά του Κοκκαρίου, πάνω σε ένα παρακλάδι του βουνού Αμπέλου, και σε ύψος 360 μέτρα από την θάλασσα και σε απόσταση 20 περίπου χιλιόμετρα βορειοδυτικά από την πρωτεύουσα.

Το Παλαιόκαστρο βρίσκεται στη Ν.Α. του νησιού και πήρε το όνομά του από τα ερείπια ενός κυκλωπείου τείχους.

Το Πυθαγόρειο βρίσκεται στα Ν.Α. του νησιού και η αρχική του ονομασία ήταν Τηγάνι.

Η σημερινή πόλη της Σάμου (Το παλιό όνομά της είναι Λιμάνι Βαθυού) κτίστηκε τις τελευταίες δεκαετίες. Παλιά δεν υπήρχε κανένα σπίτι, παρά λίγες εμπορικές αποθήκες.